代开票已征税款的处理。实行企业所得税核定征收办法的纳税人，由税务机关代开发票时征收的企业所得税，作为预缴企业所得税处理，在年度汇算清缴时一并计算，多退少补。

本通知第一条第(一)款所称支付给海关的查验费、仓储费，是指支付给海关指定的海关监管点(即海关监管仓库或场地)的费用。支付给海关的打单费、电子报关平台费;是指支付给预录入单位的费用。

市局2005年1月7日下发《关于本市实施国家税务总局修订后的〈增值税一般纳税人纳税申报办法〉的通知》（沪国税稽〔2004〕89号）后，各单位积极推行新增值税申报办法，成效明显。

建设单位作为营业税扣缴义务人的，应按照营业税纳税人纳税申报办法的规定，办理营业税纳税申报。纳税人已办理税务登记或临时税务登记的，仍按照沪税政一[1994]157号文的规定办理有关纳税事宜。

企业若能提供原《免税证明》其中任何一联的，只需凭填写完整的《补办证明单》和原《免税证明》任何一联(原件)，向市财税三分局申请补办免税证明。

根据沪国税流[2006]84号文规定，对已列入嵌入式软件名单的增值税一般纳税人，如符合财税[2006]174号文规定条件的，其已销售的软件部分，可按规定享受有关增值税即征即退政策。

对财税[2006]162号文件第一条，在国家税务总局未作统一规定前，纳税人在缴纳印花税时，应事先将电子文本中涉及印花税计税依据等相关内容打印成纸质文本，并据以办理印花税缴纳事项。

纳税人在纳税年度内，无论盈利、亏损，或处于减免税期，均应根据《中华人民共和国企业所得税暂行条例》及其实施细则及税收法规规定，办理年度企业所得税纳税申报。

纳税人取得的2006年12月31日以前开具的旧版货运发票应在发票开具日90天后的第一个纳税申报期(2007年3月纳税申报所属期)结束以前申报抵扣，超过期限的不得抵扣。

单位和个人使用的半挂牵引车属机动车，暂可按其自重(或整备质量)比照载货汽车的载重吨位计征车船使用税。半挂牵引车的自重(或整备质量)以车辆管理部门核发的车辆登记证书或行驶证书相应项目所载数额为准。

用税控收款机管理系统采集的普通发票实际开票金额与上述还原的含税销售额加上《增值税纳税申报表(适用于小规模纳税人)》中第7、9栏“本月数”之和比对，两者的逻辑关系必须相等。

企业当年实际发生的捐赠额不在主表的扣除项目中反映，全部在附表八《捐赠支出明细表》中填报，允许税前扣除的公益性捐赠以申报表主表第16行“纳税调整后所得”为基数计算。

先申报，后抄税，抄税成功后，税控IC卡自动清零解锁，但征管系统不能购买发票，须经比对成功后，征管系统自动解除票控，纳税人才可以购买发票;比对异常的，经异常处理岗位处理结束后，人工解除票控，纳税人才可购买发票。

主管税务机关审核时发现纳税人应报送而未报送《农产品抵扣清单》或者审核结果有误的，应要求其补报或对相关数据修改后重新申报。未按规定报送《农产品抵扣清单》，或者未按规定的要求填写《农产品抵扣清单》的，不得抵扣进项税额。

纳税人在办理自行纳税申报时，不涉及补缴、退还个人所得税税款的，可选择采用邮寄申报和网上申报方式向其主管税务机关办理自行纳税申报的相关事项;涉及补缴、退还个人所得税税款的，应到其主管税务机关办税服务厅办理自行纳税申报的相关事项。

收回原代售单位所持存的未出售的印花税票、印花税票销售凭证、税收缴款书、经管的票证章戳、票款结报手册、《许可证》以及其他应当收回的资料、物品时应填制交接清单，并由移接交双方单位和经办人签章。

纳税人采用新营业税纳税申报表第一个月，其前一个月有营业税欠缴税金的，应在新营业税纳税申报表的“期初欠缴税额”栏填写;

本次采用的货运发票税控系统由总局统一开发，原本市使用的《公路内河货物运输统一开票软件》停止使用，全部启用全国统一的货运发票税控系统开票软件，软件的培训和维护由本市专业计算机公司向纳税人免费提供。

各单位在系统升级前，如已发生有关合同备案货物的出口退税审核，须用红字冲减方法调整原申报审核数据，再利用升级软件重新组织退税申报、审核。

凡在2006年7月1日至本《操作办法》下发前主管税务机关已办理退税的外商投资项目，企业应按《操作办法》向市发展改革委申请补办“项目确认书”和“设备清单”；2006年11月30日前未取得市发展改革委出具的“项目确认书”和“设备清单”的，主管税务机关将向企业收回已退国产设备税款。

如遗失车船使用税纳税凭证，可凭由税务机关核发的，记载完整、未经涂改的交易车辆的《车船使用税纳税记录卡》，向原主管税务机关申请办理已纳税证明。

鉴于目前海关对核准单的具体开具办法尚未明确，为了做到核准单与发票一一对应，允许钻交所对核准单进行分割，钻交所应将分割的核准单建立明细帐，以备税务机关核查。

自2006年7月1日至2006年12月31日，对属于增值税一般纳税人的本市家禽加工企业和冷藏冷冻企业加工销售禽肉产品实行增值税即征即退政策，并免征城市维护建设税、教育费附加及河道工程修建维护管理费。

实行查帐征收方式的个体工商户，10月份预缴申报时，应一并计算7、8、9月份的调减额，从10月份的应预缴税额中冲抵，不足冲抵的部分在今年以后各月的应预缴税额中冲抵，直至完全冲抵。

现将《财政部 国家税务总局关于以三剩物和次小薪材为原料生产加工的综合利用产品增值税即征即退政策的通知》(财税[2006]102号)转发给你们，并结合本市实际补充规定如下，请一并按照执行。

各税务分局要采取有效措施，通过各种途径，将《通知》精神及时向出口企业进行广泛宣传，确保出口企业能及时了解出口退税政策调整的有关内容。

为了进一步落实科教兴市主战略，更好地发挥信用担保促进科技创新企业发展的作用，根据上海市人民政府《关于实施〈上海中长期科学和技术发展规划纲要(2006—2020年)〉若干配套政策的通知》(沪府发〔2006〕12号)的精神，我们制定了《关于本市担保机构代偿损失实施补偿的暂行办法》，现印发给你们，请认真按照执行。

个人转让自有住房并拟在现住房转让1年内按市场价重新购房的，其转让现住房时应缴纳的个人所得税税款，应在办理交易过户和转移登记手续前，以纳税保证金形式缴纳。

根据《国家税务总局关于完善税务登记管理若干问题的通知》(国税发[2006]37号)和《国家税务总局关于换发税务登记证件的通知》(国税发[2006]38号)的规定，市局决定统一换发本市纳税人的税务登记证件。

为进一步规范本市房地产交易市场的税收征收管理，促进各类房产交易税收政策落到实处，维护纳税人的合法权益，方便纳税人办税，现就房地产交易市场的税收征收管理提出以下操作意见：

对新发生出口业务企业的应退税额，主管税务分局可在退税审核期期满后的当月对上述各月的审核无误的应退税额一次性退给企业；对小型出口企业各月累计的应退税额，主管税务分局可在次年一月一次性办理退库。